lénticos: lagos El Ocotal, Lacanjá, Miramar, Ojos Azules, Escobar, Suspiro, el Tintal y otras

lóticos: ríos Usumacinta, Xabal, Lancantún, Aguilar, Chixoy, Lacanjá, Azul, Perlas, Jetjá, Negro-Tzendales, San Pedro y arroyos

Limnología básica: la región comprende un balance hídrico favorable y por lo tanto una elevada actividad morfogenética características de un karst activo. Representa una cuenca muy importante de captación de las elevadas precipitaciones de la región y, por lo tanto, actúa como zona de recarga de acuíferos subterráneos que alimentan al sistema fluvial más caudaloso del país.

Geología/Edafología: comprende las sierras La Cojolita, Cruz de Plata, La Colmena y El Tornillo. Predominio de calizas cretácicas y rocas sedimentarias plegadas. Suelos tipo Litosol, Nitosol, Luvisol, Cambisol y Rendzinas.

Características varias: clima cálido húmedo y cálido subhúmedo con abundates lluvias en verano. Temperatura media anual de 22-28 ^oC. Precipitación total anual 1500-3000 mm.

Principales poblados: Bonampak, Monte Líbano, Zapotal, San Quintín, Taniperla, Pico de Oro, Velasco Suárez, Lacanjá

Actividad económica principal: ganadera, forestal y petrolera

Indicadores de calidad de agua: ND

Biodiversidad: tipos de vegetación: selva alta perennifolia, selva mediana subcaducifolia, bosques de pinos y encinos, vegetación riparia y sabana. La vegetación secundaria más frecuente son los acahuales que cubren grandes extensiones. Flora característica: espino Acacia pennatula, Alchornea latifolia, Ardisia spicigera, bayalté Aspidosperma megalocarpon, Ateleia pterocarpa, Bactris balanoidea, Balizia leococalyx, jimbal Bambusa longifolia, palo de cuesa Bernoullia flammea, Blepharidium mexicanum, Bletia purpurea, Bravaisia integerrima, ramón Brosimum alicastrum, pucté Bucida buceras, chacá Bursera simaruba, Byrsonima crassifolia, Cabomba palaeformis, leche maría Calophyllum antillanum, hule Castilla elastica, Cecropia obtusifolia, C. schreberiana, cedro rojo Cedrela odorata, ceiba Ceiba pentandra, baqueta Chaetoptelea mexicana, sibal C. jamaicense, Cladium mariscus, Clusia flava, Cochlospermum vitifolium, Cojoba arborea, Coussapoa oligocephala, Crescentia cujete, Cupania sp., Curatella americana, Cymbopetalum penduliflorum, guapaque Dialium guineense, Eleocharis interstincta, Ficus cookii, F. glabrata, pataté Ginoria nudiflora, Gliricidia sepium, jimbales de Guada spinosa, palo de chombo Guatteria anomala, Gynerium sagittatum, platanillos Heliconia latispatha, Hymenaea courbaril, Hymenocallis littoralis, Inga sapindoides, I. vera spuria, Lemna minuta, sunzapote Licania platypus, Lindenia rivalis, palo de aro Lonchocarpus guatemalensis, L. luteomaculatus, Ludwigia octovalvis, Luehea speciosa, Lysiloma acapulcense, bejuco de sangre Machaerium marginatum, chicozapote Manilkara zapota, zarzales de Mimosa pigra, Muntingia calabura, Myrica mexicana, Myriophyllum sp., Najas wrightiana, Nymphaea ampla, palo de agua Pachira aquatica, Pancratium littorale, carrizal Phragmites australis, Phyla stoechadifolia, pinos Pinus oocarpa, P. pseudostrobus, P. tenuifolia, hormiguillo Platymiscium dimorphandrum, Polygonum acuminatum, Pontederia sagittata, manash Pseudolmedia oxyphyllaria, llorasangre Pterocarpus rohrii, Quararibea funebris, encinos Quercus anglobonduensis, chicharro Q. corrugata, cantulán colorado Q. oocarpa, Q. peduncularis, tzajal Q. skinneri, pasto marino Ruppia maritima, Salix humboldtiana, corozales de Scheelea liebmannii, guanacaxtle Schizolobium parahybum, Scirpus sp., chechem Sebastiana longicuspis, Spirodela polyrrhiza, Spondias mombin, castaño Sterculia apetala, covadonga Strychnos panamensis, caoba Swietenia macrophylla, volador Talauma mexicana, canshán Terminalia amazonia, tule Typha domingensis, Utricularia gibba, tinco Vatairea lundellii, cacao volador Virola guatemalensis, yashcabté Vitex kuylenii, Wolffia brasiliensis. Fauna característica: Para la selva Lacandona se han reportado 22 especies de oligoquetos terrestres: 15 nativas de México (4 géneros y 11 especies nuevas), 5 introducidas por el hombre y 2 (Ocnerodrilus occidentalis y Gen. Nov. 1) de origen dudoso: Amynthas corticis, Balanteodrilus pearsei, Dichogaster bolaui, D. saliens, D. sporadonephra, Notiodrilus salvadorensis, Polypheretima elongata, Pontoscolex corethrurus, Ramiellona strigosa, Lavellodrilus bonampakensis, L. ilkus, L. maya, L. parvus, L. riparius; de peces Gambusia eurystoma, Heterandria bimaculata, Profundulus hildebrandi, P. labialis, Xiphophorus alvarezi, X. helleri; de anfibios y reptiles la boa Boa constrictor, las nauyacas real Bothrops asper, chatilla B. nasuta y verdinegra B. nigroviridis, los sapos Bufo marinus y B. valliceps, el celesto vientre verde Celestus rozellae, la tortuga cocodrilo Chelydra serpentina, la culebra Clelia clelia, la panza amarilla Coniophanes fissidens, la vientre rojo C. imperialis, los cocodrilos Crocodylus acutus y C. moreleti, la tortuga blanca Dermatemys mawii, Eleutherodactylus laticeps, la iguana verde Iguana iguana, el falso coralillo Lampropeltis triangulum, Norops uniformis, la rana leopardo Rana berlandieri, tres lomos Staurotypus triporcatus, la jicotea Trachemys scripta, la falsa nauyaca Xenodon rabdocephalus; de aves residentes como Agamia agami, la anhinga americana Anhinga anhinga, la garza ganadera Bubulcus ibis, la aguililla gris Buteo nitidus, el garzón blanco Casmerodius albus, el pato pijije aliblanco Dendrocygna autumnalis, el halcón guaco Herpetotheres cachinnans, la cigüeña americana Mycteria americana, la chachalaca vetula Ortalis vetula, la garza tigre Tigrisoma mexicanum; de aves invernantes como el playerito alzacolita Actitis macularia, la cerceta aliazul clara Anas discors, el garzón cenizo Ardea herodias, el aguililla migratoria menor Buteo platypterus, el martín pescador mediano Ceryle alcyon, el chorlito semipalmeado Charadrius semipalmatus, el chorlito tildío C. vociferus, el mosquerito mínimo Empidonax minimus, el halcón cernícalo Falco sparverius, el águila pescadora Pandion haliaetus, la perlita piis Polioptila caerulea; de mamíferos como el tepescuintle Agouti paca, el cacomixtle Bassariscus sumichrasti, el armadillo de cola desnuda Cabassous centralis, el tlacuache lanudo o dorado Caluromys derbianus, el tlacuachillo acuático Chironectes minimus, el puercoespín Coendou mexicanus, el hormiguero dorado Cyclopes didactylus, el guaqueque alazán Dasyprocta punctata, el armadillo Dasypus novemcinctus, los murciélagos hematófagos Desmodus rotundus y Diphylla ecaudata, el tlacuache común Didelphis marsupialis, el viejo de monte Eira barbara, el grisón Galictis vittata, la nutria Lutra longicaudis, el ratón tlacuache Marmosa mexicana, el venado temazate Mazama americana, la comadreja Mustela frenata, el coatí Nasua narica nelsoni, el venado cola blanca Odocoileus virginianus, la tusa Orthogeomys hispidus, el tlacuache cuatro ojos Philander opossum, los murciélagos Lonchorhina aurita, Micronycteris brachyotis, M. megalotis, Mimon benettii cozumelae, M. crenulatum, Myotis albescens, M. elegans, M. fortidens, M. keaysi, Noctilio leporinus, Peropteryx kappleri, Phyllostomus stenops, Pteronotus davyi, P. parnellii, Rhynchonycteris naso, Saccopteryx bilineata, Tonatia brasiliense, T. evotis, el murciélago carnívoro Trachops cirrhosus, la martucha Potos flavus, el mapache Procyon lotor, las ardillas Sciurus aureogaster y S. deppei, el conejo tropical Sylvilagus brasiliensis, la zorra gris Urocyon cinereoargenteus. Endemismo de plantas Ceratozamia matudai, C. mexicana, Chamaedorea glaucifolia, Dioon merolae, Encyclia kienastii, Lacandonia schismatica, cacao Theobroma cacao subsp. cacao forma lacandonense, Yucca lacandonica, Zamia splendens; de crustáceos Odontothelphusa lacandona, O. palenquensis, Potamocarcinus chajulensis, de peces Gambusia eurystoma, Poecilia sulphuraria, Profundulus hildebrandi, Xiphophorus alvarezi y del ave Atlapetes albinucha. Especies amenazadas: de reptiles los cocodrilos Crocodylus acutus, C. moreleti y la tortuga blanca Dermatemys mawii; de aves el loro de cabeza azul Amazona farinosa, la guacamaya roja Ara macao, búho cornudo cariblanco Asio clamator, el pato real Cairina moschata, el hormiguero tirano Cercomacra tyrannina, el hocofaisán Crax rubra, el milano tijereta Elanoides forficatus, el halcón pechicanelo Falco deiroleucus, el hormiguero cholino escamoso Grallaria guatimalensis, el águila arpía Harpia harpyja, el águila solitaria Harpyhaliaetus solitarius, el loro de corona blanca Pionus senilis, el búho gorfiblanco Pulsatrix perspicillata, el tucán pico multicolor Ramphastos sulfuratus, el zopilote rey Sarcoramphus papa, el águila elegante Spizaetus ornatus, el águila tirana S. tyrannus, el águila ventriblanca Spizastur melanoleucus, el trogón colioscuro Trogon massena; de mamíferos el mono aullador Alouatta pigra, el mono araña Ateles geoffroyi, el puercoespín Coendou mexicanus, el grisón Galictis vittata, el jaguarundi Herpailurus yagouaroundi, el ocelote Leopardus pardalis, la nutria Lutra longicaudis, el jaguar Panthera onca, el puma Puma concolor, el oso hormiguero Tamandua mexicana, el tapir Tapirus bardii, el pecarí de labios blancos Tayassu pecari, el murciélago carnívoro Trachops cirrhosus, todas amenazadas por modificaciones del hábitat y migraciones de la población tzotzil. Especies indicadoras: de anfibios y reptiles anolis jaspeado Anolis capito, Centrolenella fleischmanni, el turipache de selva Corytophanes cristatus, Physalaemus pustulosus, el sapo cavador Rhinophrynus dorsalis y la escincela parda Sphenomorphus cherriei, indicadoras de calidad del medio ambiente.

Aspectos económicos: actividad agrícola, ganadera, forestal, petrolera, turística y pesquera.

- Modificación del entorno: desforestación, modificación de la vegetación (fragmentación) y erosión de suelos por actividades ganadera y petrolera; así como por colonización espontánea y construcción de carreteras.

- Contaminación: por agroquímicos.

- Uso de recursos: especies introducidas de peces como la anguila Anguilla rostrata, la mojarra Cichlasoma urophthalmus ericymba, la carpa hervíbora Ctenopharyngodon idella y la tilapia Oreochromis niloticus. Pesca comercial de los bagres Ariopsis felis y Cathorops melanopus, el macabil Brycon guatemalensis, la castarrica Cichlasoma octofasciatum, el bobo liso Ictalurus meridionalis, la chopa Ictiobus meridionalis, el pejelagarto Lepisosteus tropicus, la tenguayaca Petenia splendida, el coruco Potamarius nelsoni. Especies de insectos con valor comercial: Archaeoprepona demophoon gulina, Callipogon barbatum, Eurytides lacandones, Megasoma elephas, Parides sesostris zestos, Protesilaus protesilaus macrosilaus. Cultivos de maíz, chile, frijol, calabaza, yuca, ajonjolí, plátano, café y caña de azúcar. Actividad pecuaria de bovinos, porcinos, ovinos, avícola y apícola. Recolección de algunas especies silvestres de palmas Chamaedorea spp y cambray y de plantas medicinales entre otras. Hay violación de vedas, cacería furtiva y un severo tráfico de fauna y flora. Además de la gran riqueza de especies y ecosistemas y de su contribución en la forma de servicios ecológicos, es de resaltar su potencial como fuente de recursos útiles. Extracción de leña y madera; agricultura itinerante y explotación petrolera.

Conservación: preocupa la desforestación intensiva, la contaminación y la posible pérdida de especies por explotación de carpas. Faltan estudios de la calidad y cantidad del agua y el arrastre de sólidos, así como de la biota en general. Ante la multitud de conflictos actuales y potenciales de esta zona, es necesario hacer una evaluación ecológica y social con la participación de todos los grupos que tienen intereses en ella, así como una ordenación ecológica. Debe controlarse la cantidad de asentamientos humanos en las zonas protegidas. Falta vigilancia para controlar el tráfico ilegal de especies por parte de las autoridades competentes. Comprende la Reserva de la Biosfera Lacantún y parte de Montes Azules, los Monumentos Naturales de Bonampak y Yaxchilán y el Área de Protección de Flora y Fauna Chan-Kin.