Se llevaron a cabo cuatro análisis de PAE, dos se efectuaron con 1014 especies de anfibios y reptiles de la República Mexicana en cuadros de un grado y medio grado, y otros dos para las 564 especies de herpetozoos endémicos a México. Se obtuvieron 63 áreas de endemismo con la matriz de todas las especies con cuadros de medio grado; 56 áreas de endemismo resultaron de la combinación cuadros de medio grado con especies endémicas; para la matriz de cuadros de un grado con todas las especies se obtuvieron 27 áreas de endemismo y con especies endémicas con cuadros de un grado resultaron 25 áreas de endemismo. Las áreas obtenidas en las cuatro combinaciones presentan muchas homologías, existiendo casos en que el área se mantiene sin importar la combinación (tamaño de cuadro-especies). Esto nos indica que las áreas congruentes tienen una historia evolutiva en común haciendo éstas zonas importantes para estudiar y conservar. Además se realizaron análisis de riqueza y complementariedad para la República Mexicana.