El Parque Nacional Sistema Arrecifal Veracruzano (PNSAV) es el único parque marino de México expuesto a efectos locales tan fuertes como las descargas del río Jamapa, que descarga 1670 x106 m3 año, y bajo la influencia ocasional del Río Papaloapan que descarga 20000x106 m3 año. Es también la zona coralina junto a la ciudad costera más grande México y por el parque atraviesan los barcos del que es también el puerto más grande del país, con un tráfico anual de entre 1809 y 1505 buques. De esta manera se tienen múltiples factores de impacto: el influjo de descargas municipales, industriales y agropecuarias de los centros urbanos adyacentes y cercanos, aunado a lo cual se tiene el vertimiento de contaminantes y sedimentos terrígenos provenientes de las cuencas hidrológicas así como las actividades portuarias del área que provocan la resuspensión de sedimentos finos y además eventuales derrames de hidrocarburos y otras sustancias nocivas. Por los motivos anteriores, es importante realizar, un monitoreo del área que permita detectar los cambios en los recursos, ya sea como respuesta directa a acciones locales o bien como respuesta a eventos de mayor escala. Durante el monitoreo se colocarán trampas de sedimentos en varios puntos del arrecife, lo cual nos dará información bimestral de la sedimentación en distintos puntos del parque, se medirán parámetros fisicoquímicos que permitan describir los cambios mensuales de temperatura y salinidad en el área de estudio, se determinará la cobertura coralina yla composición de especies mediante fotografías digitales sobre los transectos, se determinará mediante mediciones directas la incidencia de enfermedades en corales, así como la presencia de blanqueamiento y el reclutamiento coralino se determinará la distribución y abundancia de peces, la abundancia de reclutas y las tallas de los individuos de las familias que contienen a las principales especies capturadas por la pesca artesanal y finalmente se realizará buceo errante para completar la lista de especies y conocer la diversidad biológica de pecesCon toda la información recopilada se elaborará un modelo ecotrófico del ecosistema, con el cual sea posible determinar las posibles respuestas ante cambios en los componentes del ecosistema, en los regímenes de pesca o como resultado de medidas de manejo adoptadas.