Los dinoflagelados representan un grupo exitoso de protistas unicelulares que combinan estrategias fotosintéticas, heterotróficas e incluso parásitas. Su gran diversidad de formas, historias de vida y mecanismos de dispersión les han permitido colonizar la mayoría de los ambientes acuáticos. Así, se pueden encontrar tanto en ambientes dulceacuícolas como marinos, formando parte del medio pelágico o bentónico. Como parte del bentos, los dinoflagelados son un componente muy importante en los ecosistemas arrecifales, donde, suelen formar asociaciones con una gran variedad de macroalgas y pastos marinos. Existe una gran cantidad de especies que han sido descritas recientemente para el Caribe, por lo que es probable que el número de especies en el sistema arrecifal de la costa de Quintana Roo sea elevado e incluso, es posible que se obtengan registros de nuevas especies. Por lo anterior, el presente estudio pretende contribuir al conocimiento de la diversidad de dinoflagelados bentónicos del Caribe Mexicano, mediante un muestreo extensivo a lo largo del sistema arrecifal de la costa de Quintana Roo y dirigido a la colecta de macroalgas, pastos marinos, detritus flotante, fondo arenoso y columna de agua. Asimismo, se pretende realizar cultivos de las especies seleccionadas, lo cual permitirá resolver problemas taxonómicos referentes a la potencial presencia de especies crípticas en la región. Uno de los alcances más relevantes de la ejecución de la presente propuesta es que los registros de las especies serán fundamentales para estudios posteriores sobre aspectos ecológicos, o incluso epidemiológicos, en el caso de los dinoflagelados tóxicos.