Desde el año de 1996 a la fecha, tanto los colaboradores del Laboratorio de Fitoplancton Marino y Salobre del Departamento de Hidrobiología de la UAM Iztapalapa, como del Laboratorio de Fitoplancton y Productividad Primaria del Instituto de Ciencias del Mar y Limnología, UNAM, han estado desarrollando proyectos florísticos-taxonómicos que incluyen a los grupos de diatomeas (Bacillariophyta) y dinoflagelados (Dinophyta), tanto en el Pacífico Mexicano como en el sur del Golfo de México, de manera que a la fecha se cuenta con 10 bases de datos (de las cuales ocho están unificadas en dos), producto de 10 proyectos de investigación financiados por la CONABIO, que incluyen al menos 842 taxa de diatomeas planctónicos y ticoplanctónicos, y 442 de dinoflagelados planctónicos para el Pacífico Mexicano, así como 370 taxa de diatomeas planctónicas y ticoplanctónicas y 282 de dinoflagelados planctónicos para sur del Golfo de México. Con esta información, más la generada por diversos autores que trabajan estos grupos en costas mexicanas (haciendo una revisión exhaustiva de las publicaciones en los últimos 15 años), más la información que se generará por los grupos de trabajo involucrados en el presente proyecto, se crearán dos bases de datos en el sistema de información Biótica con datos nomenclaturales; uno para diatomeas (Bacillariophyta, aproximadamente 930 taxa planctónicos y ticoplanctónicos con nombre correcto) y otro para dinoflagelados (Dinophyta, aproximadamente 500 taxa planctónicos con nombre correcto), que permitirán integrar y confirmar los registros de estas algas planctónicas en costas mexicanas; así como aumentar el numero de taxa registrados en México con los resultados de investigaciones en marcha. Dichos catálogos incluirán además de las referencias nomenclaturales, los basiónimos y sinónimos asociados, comentarios sobre la validez de los nombres, diagnosis taxonómicas, ilustraciones y fotografías de al menos 570) de los taxa que serán confirmados para las costas mexicanas, así como mapas de distribución de cada taxón en las costas de México, a partir de los registros geo-referenciados. De esta manera se elaborarán dos catálogos de autoridades taxonómicas (uno para diatomeas y otro para dinoflagelados), que en conjunto contendrán 2,154 nombres (considerando nombres correctos, basiónimos, sinónimos y nombres mal aplicados), distribuidos en 229 géneros pertenecientes a las dos Divisiones algales en cuestión: Bacillariophyta y Dinophyta. Este proyecto permitirá incrementar el Catálogo de autoridades taxonómicas de las algas de México en un porcentaje de al menos 3%. Palabras clave: Catálogo taxonómico anotado, Fitoplancton, Bacillariophyta, Dinophyta, Pacífico Mexicano, sur del Golfo de México.