El proyecto "Flora del Bajío y de Regiones Adyacentes" fue iniciado en 1985 y tiene como principal finalidad la elaboración y publicación de un inventario detallado de las especies de plantas vasculares que prosperan en forma espontánea en los estados de Guanajuato, Querétaro y en la parte norte del de Michoacán. Es un esfuerzo cooperativo y crítico, en el que están participando los investigadores del Instituto de Ecología, así como numerosos botánicos de otras instituciones mexicanas y algunos especialistas extranjeros. Se está publicando en fascículos, cada uno correspondiente en principio a una familia botánica. Además de la información convencional que se acostumbra incluir en este tipo de obras (nombre científico, sinónimos y descripción de cada taxon, claves a todos los niveles, datos sobre distribución geográfica y ecológica, enumeración de ejemplares, ilustraciones, comentarios sobre abundancia, variabilidad, relaciones con otras especies, etc.) se está proporcionando una apreciación relativa de la vulnerabilidad de la planta a la extinción y se aplica especial énfasis a la presentación de datos tan completos como sea posible acerca de usos, propiedades y nombres comunes. Después de una etapa de intensa exploración del área, en 1991 se inició la fase de la propia elaboración, edición y publicación de la Flora. Hasta la fecha aparecieron impresos 176 fascículos de la misma, así como 27 fascículos complementarios; estos últimos versan sobre diversos aspectos del universo vegetal de la zona de estudio. Todos los fascículos tienen acceso abierto para su consulta a través de la página de internet del Instituto de Ecología, A.C. y los de los números 1 a 100 están también disponibles en forma de disco. A partir de julio de 1993 se está contando con el subsidio otorgado por la Comisión Nacional para el Conocimiento y Uso de la Biodiversidad (proyecto J080), gracias al cual se ha podido asegurar la continuidad del proceso editorial. Se ha estado recibiendo asimismo apoyo financiero de parte del Consejo Nacional de Ciencia y Tecnología, de la Coordinación de la Investigación Científica de la Universidad Michoacana, así como del Consejo de Ciencia y Tecnología del Estado de Querétaro. En forma paralela, la CONABIO ha patrocinado también la adquisición de muebles para el herbario de Pátzcuaro, así como la elaboración de una base de datos, en la que se está concentrando la información vertida en las etiquetas de los ejemplares de nuestra colección. El herbario, que constituye la herramienta fundamental del proceso de preparación de la Flora, a la fecha reúne más de 225,000 ejemplares de plantas vasculares, de los cuales cerca de la mitad corresponde al material procedente de la región de estudio y la parte restante proviene en su mayoría de áreas ecológicamente similares del centro y norte de México. Es el cuarto más importante entre los existentes en el país. Está ubicado en muebles del tipo de los compactores, se le presta un intenso apoyo curatorial, se encuentra abierto al público para su consulta y mantiene un activo programa de préstamos e intercambios con numerosas instituciones nacionales y extranjeras.