El Herbario QMEX es un centro de carácter estatal, está incorporado a la Universidad Autónoma de Querétaro y adscrito a la Facultad de Ciencias Naturales. Esta última, se encarga de su mantenimiento, permanencia y crecimiento planificado. Los objetivos del herbario son: Albergar las colecciones botánicas que representan principalmente la flora de Querétaro, así como otras regiones del país; servir de herramienta básica para investigadores y estudiantes; divulgar, en todos los niveles, la importancia de preservar, conservar y manejar los recursos naturales; y colaborar en la información, para floras regionales y nacionales. Por otra parte, tiene estrecha vinculación con el herbario del INECOL del Bajío (IEB), dado que el Dr. Rzedowski y su equipo están elaborando la flora del Bajío, en la cual se incorpora la de Querétaro, por lo que constantemente efectúan visitas a nuestro herbario, para revisar y actualizar los ejemplares. A la fecha, se tiene un acervo aproximado de 36 000 ejemplares de plantas vasculares. Se cuenta con colecciones de: plantas útiles (1800), musgos y líquenes (1050), así como de semillas. Se tienen 59 ejemplares tipo: 22 Isotipos, 34 Paratipos y 3 Holotipos. En la primera fase de la base de datos, se llevaron a cabo las revisiones de diversas familias. Sólo se lograron revisar un 30% del total de las plantas vasculares. Se capturaron en la base de datos Biótica 4.5.5, un total de 19 805 registros, se georreferenciaron 90 % de las localidades y se herborizaron alrededor de 6 000 ejemplares. Para la segunda etapa de la base de datos, se revisó un 40% más del total de las plantas vasculares que no se habían revisado, teniendo aproximadamente un 70% del total de la colección. Se capturaron en la base de datos Biótica 5.0, la base ya existente y un total de 8 000 registros más, para un total de 27 805 ejemplares, se georreferenciaron 7 016 ejemplares, obteniendo 25 027 ejemplares, esto es un 90% del total de la colección computarizada y se herborizaron alrededor de 1000 ejemplares. Para este proyecto se pretenden digitalizar 1 500 ejemplares, de la colección, ya computarizada. La computarización de 4 000 registros nuevos en la base de datos y la georreferencia del 90 % de dichos ejemplares. Así como, también la digitalización, la revisión y la actualización taxonómica de los mismos 4 000 ejemplares.