El herbario del Instituto de Ecología, A.C. fue establecido en la Ciudad de Xalapa, Veracruz en 1975, por el desaparecido Instituto Nacional de Investigaciones sobre Recursos Bióticos. Contiene tres colecciones importantes: plantas vasculares, hongos y musgos; siendo los estados de Veracruz, Yucatán, Quintana Roo, Campeche y Chiapas los mejor representados. Este acervo lo convierte en el principal Herbario de la provincia y el tercero a nivel nacional; constituyéndose en la actualidad como un sitio de consulta obligado para los estudiosos de la flora mexicana. El herbario ofrece servicios de consulta, asesorías y determinación de especímenes botánicos a diferentes usuarios entre ellos, investigadores y estudiantes de universidades e instituciones académicas; organismos de gobierno, sector privado y público en general.