Este proyecto tiene como objetivos principales: 1) contribuir a la organización y sistematización de la flora de la región que a partir de septiembre de 1998 se decretó como Reserva de la Biósfera; 2) contribuir regionalmente a la conformación del Sistema Nacional de Información sobre la Biodiversidad con sede en CONABIO; 3) publicar los tratamientos taxonómicos de cada una de las familias de esta flora, los cuales incluyen descripciones morfológicas de familias, géneros y especies, datos de distribución y de diversidad, así como nombres comunes y usos. Con el apoyo financiero que CONABIO nos ha otorgado desde julio de 1993 a la fecha, se ha conformado la base de datos que comprende el 97% de la flora con cerca de 2,450 especies y 15,000 registros. En lo referente a la publicación de los tratamientos taxonómicos, se han publicado 21 fascículos, que incluyen a las siguientes familias: Malvaceae, Fabaceae (Tribu Sophoreae), Poaceae (Subfamilias: Arundinoideae, Bambusoideae, Centothecoideae), Araliaceae, Linaceae, Cistaceae, Arecaceae, Melastomataceae, Dioscoreaceae, Pteridophyta (Equisetaceae, Lycopodiaceae, Selaginellaceae) Smilacaceae, Gimnospermae (Cupressaceae, Ephedraceae, Taxodiaceae, Zamiaceae), Fabaceae (Tribu Psoraleeae), Cactaceae, Hyacinthaceae, Elaeocarpaceae, Theophrastaceae, Fouquieriaceae, Convallariaceae, Mimosaceae (Tribu Acaciae), Caricaceae, Cucurbitaceae, Acanthaceae, Thymelaeaceae, Calachortaceae y Hernandiaceae. Actualmente se tienen en preparación Lentibularaceae, Fagaceae, Verbenaceae, Rhamnaceae, Fabaceae (Tribu Crotalarieae), Simarubaceae, Pedaliaceae y Lulianiaceae lo que equivale al 15% de la flora.