La CONABIO es una comisión de carácter intersecretarial encabezada por el Presidente Constitucional de México, C. Felipe Calderón Hinojosa y compuesta por los titulares de las siguientes Secretarías de Estado:

Relaciones Exteriores (SRE) Hacienda y Crédito Público (SHCP) Energía (Sener) Economía (SE) Agricultura, Ganadería, Desarrollo Rural, Pesca y Alimentación (Sagarpa) Educación Pública (SEP) Salud (SSA) Turismo (Sectur) Desarrollo Social (Sedesol) Medio Ambiente y Recursos Naturales (Semarnat)

La CONABIO cuenta con un Coordinador Nacional, Dr. José Sarukhán Kermez, quien es apoyado por un grupo operativo integrado por más de 200 personas (funcionarios, analistas y personal administrativo). El titular de la SEMARNAT funge como el Secretario Técnico de la CONABIO.