En Laguna de Términos, se presentan dos tipos de incendios: superficiales y subterráneos, la mayoría son originados por quemas agropecuarias, cacería furtiva, ampliación de las áreas de pastizal y limpieza de sitios de pesca. Una vez que estos avanzan, afectan la vegetación de pantano, selva baja y mediana, en ocasiones afectando manglares y fauna asociada a estos tipos de vegetación. La alta presencia de estos incendios en este periodo, se debió a una temporada seca de 8 meses , lo que ocasionó que las zonas de pantano pierdan su nivel de agua y toda la vegetación acumulada se convierta en combustible seco, dando lugar a constantes riesgo de incendios. La emergencia inició el día 4 de junio de 2005, cuando se presentó un primer incendio en zona de pantano de considerable magnitud, en el punto conocido como Laguna El Zapote del municipio de Palizada. Al concluir el proyecto, se evaluaron un total de 100 siniestros que dejaron como saldo un área afectada de 2,801 has de vegetación hidrófita y 20 has de macizos arbolados (matorral de Dalbergia browni y Bucidas buceras)