Ubicada en el extremo sur del país, la Reserva de la Biosfera La Encrucijada mantiene una gran riqueza biótica derivada de su privilegiada situación geográfica, en el puente natural entre la zona neártica y la neotropical. Esta región es muy importante, pues en ella se encuentran diversos tipos de vegetación representativos de la costa de Chiapas, como son: manglares, tulares, zapotonales, matorral costero, vegetación flotante y subacuática, palmares, selva mediana subperennifolia y baja caducifolia. Además, cuenta con una amplia red hidrográfica constituida principalmente por ríos, lagunas costeras, esteros, canales y bocabarras que permiten establecer un intercambio entre las aguas continentales y el mar. Los eventos extraordinarios de incendios forestales presentados entre 1997 y 1998 llevaron el tema de los incendios forestales al debate sobre la conservación y manejo de los ecosistemas forestales. Por ejemplo, en la Reserva de la Biosfera la Sepultura (REBISE) se registró un incendio forestal el día domingo 9 de abril de 2006 a través de un sobrevuelo de monitoreo realizado por personal del CECIF, en el paraje denominado el Mazateco, en los municipios de Huixtla y Mazatán, ubicado en la Zona Núcleo de la REBISE, en el estado de Chiapas. El incendio fue provocado por el uso del fuego para la captura de tortugas de agua dulce, caimán e iguana verde entre otras especies, práctica realizada por los pobladores de las comunidades circundantes que utilizan el fuego como medio de captura para abastecer al mercado regional derivado de una costumbre de consumo de fauna silvestre. Este incendio tuvo una duración de 26 días. Las acciones realizadas para controlar el incendio se llevaron a cabo a partir de la mañana siguiente en que éste fue detectado; desafortunadamente tanto por tierra como por agua el acceso al sitio del incendio era imposible dada la condición de zona pantanosa. El incendio arrojó un saldo de 2, 875 has quemadas de vegetación de tular, carrizal y popal (vegetación de pantanos de 1 a 3 m de altura), también se afectaron 71 has de Bosque de Zapotón (Árboles de 5 a 15 m de altura) y 0.5 Ha de pastizal nativo.