|
|
|
| | |
Proyecto GE021
| |
Título: |
Código de barras genético de cinco grupos críticos de la flora de México |
| |
Responsable: |
Dr. David Gernandt |
| | Correo electrónico: | dgernandt@ib.unam.mx | | | Institución: | Universidad Nacional Autónoma de México
Instituto de Biología | | | Dirección: | Cto. Zona Deportiva s/n, Ciudad Universitaria, de México, DF, 04510 , México
| | | Teléfono/Fax: | 5622 9065, | | | Fecha de inicio: | Nov 28 2008 | | | Fecha de término: | Nov 7 2011 | | | Estatus: | CONCLUIDO | | | Especies: | 170 | | | Cobertura: | | | | Resumen: | Los códigos de barras genéticos consisten en secuencias cortas y estandarizadas de DNA que permiten la identificación de las especies de organismos conocidas y el descubrimiento de especies desconocidas. A diferencia de muchos animales (y otros eucariontes) para los que el gen mitocondrial CO1 es fácil de secuenciar y altamente informativo, las plantas terrestres presentan problemas particulares para la selección de un código de barras. Esto se debe a la baja tasa de substitución y la frecuencia de rearreglos del genoma mitocondrial. También existen problemas debidos a poliploidía y paralogía en los genes nucleares. Aunque existe consenso en que el genoma del cloroplasto es la fuente más prometedora de códigos de barras genéticos para plantas, la tasa de evolución relativamente baja de muchos genes de plástidos hace necesaria la concatenación de varias secuencias para incrementar la resolución. En este proyecto se generarán códigos de barras de DNA de cloroplasto de 319 ejemplares de c. 170 especies pertenecientes a nueve familias de plantas vasculares de gran relevancia biológica, ecológica, económica y cultural en México, incluyendo Agavaceae, Cactaceae, Crassulaceae, Cupressaceae, Orchidaceae, Pinaceae, Podocarpaceae y Taxaceae. En la selección de los grupos de estudio se priorizaron los taxones listados en la Norma Oficial Mexicana NOM-059-ECOL-2001. Los códigos propuestos consistirán de secuencias concatenadas de cuatro regiones en total. Candidatos por evaluar incluyen las regiones codificantes de los genes matK, rbcL y rpoC1, y los espaciadores intergénicos trnH-psbA, psbK-psbI y dos más hipervariables por definir en el curso de este estudio.
| | | Costo: | $458,600 | | | | | | | Productos: | | | | | | | | La base de datos del proyecto fue migrada al modelo de datos del Sistema Nacional de Información sobre Biodiversidad (SNIB) en formato Access. (Modelo y diccionario de datos)
|
| | | | | | | | CONABIO-SNIB-BaseDatos | ZIP | Gernandt D., G. Salazar, F. Vergara, S. Arias, V. Sosa, A. García, J. Reyes, L. Cabrera y P. Rosas. 2011. Código de barras genético de cinco grupos críticos de la flora de México. Instituto de Ecología. Instituto de Biología. Universidad Nacional Autónoma de México. Bases de datos SNIB-CONABIO, proyecto GE021. México, D. F. |
| | | | | | | | CONABIO-SNIB-Metadato | PDF | Gernandt D., G. Salazar, F. Vergara, S. Arias, V. Sosa, A. García, J. Reyes, L. Cabrera y P. Rosas. 2011. Código de barras genético de cinco grupos críticos de la flora de México. Instituto de Ecología. Instituto de Biología. Universidad Nacional Autónoma de México. Bases de datos SNIB-CONABIO, proyecto GE021. México, D. F. |
| | | | | | | | CONABIO-SNIB-ReporteCalidad | PDF | Gernandt D., G. Salazar, F. Vergara, S. Arias, V. Sosa, A. García, J. Reyes, L. Cabrera y P. Rosas. 2011. Código de barras genético de cinco grupos críticos de la flora de México. Instituto de Ecología. Instituto de Biología. Universidad Nacional Autónoma de México. Bases de datos SNIB-CONABIO, proyecto GE021. México, D. F. |
| | | | | | | | La información de la base de datos también esta disponible en el estándar Darwin Core (DwC) vr 1.4 en archivos Excel 97-2000, tabla en Access 2000 y texto delimitado por comas. |
| | | | | | | | CONABIO-SNIB-CSV | ZIP | Gernandt D., G. Salazar, F. Vergara, S. Arias, V. Sosa, A. García, J. Reyes, L. Cabrera y P. Rosas. 2011. Código de barras genético de cinco grupos críticos de la flora de México. Instituto de Ecología. Instituto de Biología. Universidad Nacional Autónoma de México. Bases de datos SNIB-CONABIO, proyecto GE021. México, D. F. |
| | | | | | | DwC
GBIF | ZIP | El contenido de esta base de datos ha sido publicado en el sitio de GBIF (Global Biodiversity Information Facility) y puede consultarse en el siguiente vinculo:GBIF |
| | | | | | | | Informe final | PDF | Gernandt, D., Salazar, G., Vergara, F., Arias, S., Sosa V., García, A.,
Reyes, J. Cabrera, L. y P. Rosas. 2011. Código de barras genético de
cinco grupos críticos de la flora de México. Universidad Nacional
Autónoma de México, Instituto de Biología. Instituto de Ecología, A.C.,
Informe final SNIB-CONABIO, proyecto No. GE021, México D. F. |
| | | | | | | | | | | | | | | Los archivos que se pueden consultar en la sección de Productos, no necesariamente incluyen todos los resultados aportados por el proyecto. Si requiere más información puede comunicarse con Servicios Externos al correo electrónico servext@conabio.gob.mx |
| | | | |
|
