Uno de los problemas ambientales a los que se enfrenta la humanidad es la perdida de diversidad genética, esto no es exclusivo en especies silvestres, sino también en especies cultivadas, debido principalmente a la adopción de cultivos uniformes en áreas muy extensas en sustitución de las variedades indígenas. Las múltiples razas locales son potencialmente útiles en programa de mejoramiento de cultivo, es necesario instrumentar planes de conservación de dichas variedades, pero solo la conservación de éstas en sus propios sistemas de cultivo sería efectiva, ya que de esta manera se permite que continúe la evolución del reservorio genético del cultivo en cuestión. De los agroecosistemas considerados entre los más diversificados y productivos de trópicos y subtrópicos, son los huertos familiares. Se piensa que son sitios de domesticación de especies. Las condiciones de domesticación permiten un rango muy amplio de variación, ya que la presión selectiva, ejercida por el hombre ha sido muy fuerte y en ocasiones en diversas direcciones. Existen diversos trabajos que describen la diversidad de los huertos familiares en todo el mundo, sin embargo falta conocimiento a cerca de la diversidad intraespecífica de los mismos. Los huertos familiares de Yucatán son sistemas con gran riqueza de especies, superando el ciento en muchos de ellos, entre las especies frutícolas cultivadas, destacan por su frecuencia los árboles del género Annona. Son seis las especies de este género que se cultivan en los huertos Mayas de Yucatán, en especial Annona squamosa, que además de consumir sus frutos, la gente de la península la utilizan como medicina. Se propone el estudio de la diversidad intraespecífica de Annona squamosa en los huertos familiares de diez comunidades de cinco regiones socioeconómicas en la Península de Yucatán. El estudio se realizará a través del análisis de isoenzimas en hojas, obteniendo la diversidad en cada comunidad, entre comunidades de una misma región y entre regiones. Los resultados que se obtengan permitirán sugerir planes de manejo de Annona squamosa en los huertos familiares.