Proyectos Financiados

Proyecto HB037
   
  Título: Códigos de barras del ADN de mamíferos topotipos de México Fase I: Noroeste mexicano
  Responsable: Dr. Sergio Ticul Álvarez Castañeda
  Correo electrónico: sticul@cibnor.mx
  Institución: Centro de Investigaciones Biológicas del Noroeste SC
  Dirección: Mar Bermejo # 195, Playa Palo de Santa Rita, La Paz, BCS, 23090 , México
  Teléfono/Fax: Tel: 01 (612) 123 8486 01 (612) 123 3625 01 (612) 125 3633 Fax: 01 1 125 3625 - 612 12 38 486 -
  Fecha de inicio: Oct 30 2009
  Fecha de término: Mar 13 2012
  Estatus: CONCLUIDO A SATISFACCIÓN TOTAL
  Ejemplares: 940
  Especies: 70
  Cobertura:
Regional     Noroeste mexicano (7 estados)
  Región:
Sinaloa    
Chihuahua    
Nayarit    
Durango    
Baja California Sur    
Sonora    
Baja California    
Coahuila    
  Resumen: El topotipo es un espécimen colectado en la misma localidad que el ejemplar tipo (con el que se describe a una especie) y que se presume pertenece a la misma especie, por lo que tiene implicaciones importantes en el reconocimiento de la especie. Por ser de la misma localidad, se considera que los topotipos pertenecen a la misma población del ejemplar tipo; por lo tanto, tienen los mismos atributos taxonómicos como coloración, morfología, tamaño y forma, y en el caso particular que nos ocupa, es extremadamente probable que tenga el mismo haplotipo (información genética mitocondrial) que el ejemplar tipo. El topotipo tiene la ventaja de ser un tejido fresco, recientemente colectado, de esta manera se pueden obtener secuencias de mejor calidad que del ejemplar tipo, el cual es viejo y está sujeto a las limitaciones del conservador. Por ello, el topotipo es la mejor alternativa, sobre todo cuando los especimenes tipos no estén disponibles. En el proyecto se obtendrán los códigos de barras de ADN mitocondrial (COI) para topotipos de al menos 150 taxa de mamíferos terrestres (carnívoros, quirópteros, didelfiomorfos, insectívoros, lagomorfos y roedores) del noroeste de México, para ser integradas a la base de datos del sistema BOLD. El proyecto contribuirá con información aplicable a la identificación de especies de mamíferos mexicanos resolviendo problemas taxonómicos que muchas de ellas presentan. Analizando la literatura reciente, así como observaciones propias del personal que presenta este proyecto, se ha detectado una gran cantidad de especies crípticas que han sido erróneamente identificadas en el pasado. Con la obtención de las secuencias del COI de los topotipos de las especies de mamíferos se podrán identificar correctamente a las poblaciones y evitar que problemas taxonómicos de este tipo sigan ocurriendo en el futuro, sobretodo cuando se desea implementar una librería de referencia. La mayor parte del material biológico (principalmente tejidos) de las especies a estudiar se encuentra albergado en la Colección de Mamíferos del Centro de Investigaciones Biológicas del Noroeste (CIBNOR) y cuentan con un número de catálogo, localidades georeferenciadas, datos de colecta y han sido identificados por un experto en los mamíferos de la región. Sin embargo, hay algunas de las especies que cuentan con un tamaño de muestra reducido (1 espécimen), por lo que durante el proyecto se hará trabajo de campo para incluir una muestra representativa para cada taxa. Cabe hacer la aclaración que las poblaciones y áreas geográficas propuestas aquí no están representadas en el sistema BOLD. El material biológico de las especies que incluye el proyecto será procesado bajo los protocolos estandarizados por el iBOL en el Nodo Regional CIBNOR. La base de datos final que se incorporará al sistema BOLD cumplirá con todas las características estipuladas para ello. Palabras clave: Identificación taxonómica, mamíferos, México, noroeste, topotipos
Costo: $408,700
  
 Productos:
  
 
Códigos de barrasPDF

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FotografíasPDF

Todas las imágenes están protegidas por la Ley de Derechos de Autor, por lo cual es indispensable que al ser utilizadas se den los créditos tanto al autor como a la CONABIO.

  
 
Informe finalPDF

Álvarez-Castañeda. S. T., y E. Rios. 2011. “Códigos de barras del ADN de mamíferos topotipos de México Fase I: Noroeste mexicano”. Centro de Investigaciones Biológicas del Noroeste, S. C. Informe final SNIB-CONABIO proyecto No. HB037. México, D.F.

  
 

La base de datos del proyecto fue migrada al modelo de datos del Sistema Nacional de Información sobre Biodiversidad (SNIB) en formato Access. (Modelo y diccionario de datos)

  
 
CONABIO-SNIB-BaseDatosZIP

Álvarez-Castañeda. S. T., y E. Rios. 2011. “Códigos de barras del ADN de mamíferos topotipos de México Fase I: Noroeste mexicano”. Centro de Investigaciones Biológicas del Noroeste, S. C. Bases de datos SNIB-CONABIO, proyecto No. HB037. México, D.F.

  
 
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Álvarez-Castañeda. S. T., y E. Rios. 2011. “Códigos de barras del ADN de mamíferos topotipos de México Fase I: Noroeste mexicano”. Centro de Investigaciones Biológicas del Noroeste, S. C. Bases de datos SNIB-CONABIO, proyecto No. HB037. México, D.F.

  
 
CONABIO-SNIB-ReporteCalidadPDF

Álvarez-Castañeda. S. T., y E. Rios. 2011. “Códigos de barras del ADN de mamíferos topotipos de México Fase I: Noroeste mexicano”. Centro de Investigaciones Biológicas del Noroeste, S. C. Bases de datos SNIB-CONABIO, proyecto No. HB037. México, D.F.

  
 

La información de la base de datos también esta disponible en el estándar Darwin Core (DwC) vr 2015-06-05 en texto delimitado por comas.

  
 
CONABIO-SNIB-CSVZIP

Álvarez-Castañeda. S. T., y E. Rios. 2011. “Códigos de barras del ADN de mamíferos topotipos de México Fase I: Noroeste mexicano”. Centro de Investigaciones Biológicas del Noroeste, S. C. Bases de datos SNIB-CONABIO, proyecto No. HB037. México, D.F.

  
 
DwC
GBIF
ZIP

El contenido de esta base de datos ha sido publicado en el sitio de GBIF (Global Biodiversity Information Facility) y puede consultarse en el siguiente vinculo:GBIF

  
 
Los archivos que se pueden consultar en la sección de Productos, no necesariamente incluyen todos los resultados aportados por el proyecto. Si requiere más información puede comunicarse con Servicios Externos al correo electrónico servext@conabio.gob.mx